命运石之门被谁杀死的

是被助手杀死的。

助手结局：冈部知道拯救真由理必须牺牲助手之后非常犹豫，被助手推了一把。二人确认感情，助手按计划回美国。当冈部下定决心按下删除的时候助手出现，向冈部告白(没说完)。冈部跳回β线。